Hasta unos 50 años atrás, a pesar de tener conocimiento del importante papel que tenían loa alimentos en la difusión de ciertas enfermedades, la microbiología de alimentos era considerada como parte de la microbiologia general y así la microbiologia de muchos productos fermentados se enseñaba en las facultades de agronomía.
Los patógenos que causaban las enfermedades eran estudiados en las escuelas de medicina y farmacia, y los análisis e investigaciones se realizaban en laboratorios de las instituciones gubernamentales.
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